重庆t3航站楼有南方航空、中国国际航空和重庆航空等航空公司。

3F值机岛为南方航空和重庆航空。

3G值机岛为海南航空、祥鹏航空、东方航空、福州航空、天津航空、乌鲁木齐航空、厦门航空、北部湾航空、上海航空、长安航空、首都航空、长龙航空、江西航空、东海航空、河北航空、成都航空、吉祥航空、桂林航空、昆明航空、奥凯航空、瑞丽航空。

3H值机岛为中国国际航空、深圳航空、山东航空和西藏航空。

乘坐国际及港澳台地区航线的，主要是两个值机岛。

3B值机岛为海南航空、天津航空、韩亚航空、立荣航空、四川航空、泰国亚洲航空、中华航空、亚航长途公司、胜安航空、春秋航空、春秋航空日本、中国南方航空、泰国微笑航空、重庆航空、印尼狮子航空、中国东方航空、泰国狮子航空、马尔代夫航空、西部航空、曼谷航空。

3C值机岛为中国国际航空、芬兰航空、四川航空、国泰港龙航空、天津航空、山东航空、卡塔尔航空、中国南方航空、香港航空、重庆航空、澳门航空和中国东方航空。