1、二者的高度不同：闽楠比金丝楠要高。闽楠的高度可以高达四十米左右，而金丝楠的高度则大约为三十米左右。

2、二者的分布范围不同：闽楠比金丝楠分布地区更加广泛。金丝楠主要分布于我国的四川、贵州等海拔高的带地区中潮湿阴暗的山谷、洼地还有湿地的旁边。而闽楠在我国的特有植物，在我国的南部、东南部及东北部等地都有分布。

3、二者对环境的适应能力不同：虽然金丝楠和闽楠都喜欢温暖湿润的环境，但金丝楠对环境的适应能力更加的强，也更加的耐热抗寒。

4、二者的果期不同：闽楠的果期在每年的10～11月，金丝楠的果期则在每年的9-10月。

5、二者的叶子形状不同：金丝楠叶片形状为椭圆形，少部分为披针形或倒披针形，而闽楠叶片为披针形或倒披针形。

闽楠只是楠木中的一个小分支，楠木中有很多不同名称的品种。目前金丝楠中比较认可的楠木中的金丝含量可以高达百分之八十以上。金丝楠中以桢楠的质量最好，而闽楠就次之。