宗教信仰不同，外国干涉，纳卡地区的归属等原因。亚美尼亚是教国家，国民大多信奉教和天主教。阿塞拜疆则主要信奉伊斯兰教。教同伊斯兰教的冲突已经持续多年，矛盾很难调和。土耳其的加入使矛盾激化。1991年纳卡宣布独立，除亚美尼亚以外未得到国际社会承认。1994年在俄罗斯调停下，两国实现停火，但归属问题悬而未决。